Program Pascasarjana Universitas Budi Luhur memiliki 4 Program Studi yaitu:
1. Program Studi Magister Manajemen, Fakultas Ekonomi dan Bisnis
Dekan : Dr. Ir. Arief Wibowo., M.Kom., M.M
Ketua : Prof. Dr. Setyani Dwi Lestari, ME
Sekretaris : Sugeng Priyanto, S.E, M.M
2. Program Studi Magister Akuntansi, Fakultas Ekonomi dan Bisnis
Dekan : Dr. Ir. Arief Wibowo., M.Kom., M.M
Ketua : Dr. Sugeng Riyadi, Ak., M.Si.
Sekretaris : Prita Andini, SE., M.Akt.
3. Program Studi Magister Ilmu Komputer, Fakultas Teknologi Informasi
Dekan : Dr. Ir. Deni Mahdiana., S.Kom., M.M., M.Kom.
Ketua : Dr. Rusdah, S.Kom., M.Kom.
Sekretaris : Dewi Kusumaningsih, M.Kom
4. Program Studi Magister Ilmu Komunikasi, Fakultas Komunikasi dan Desain Kreatif
Dekan : Dr. Nawiroh Vera, S.Sos
Ketua : Dr. Umaimah, S.Fil., M.Si
Sekretaris : Amin Aminudin, M.I.Kom
Sekretariat Program Pascasarjana
Staff Sekretariat:
1. Suparno Hadikuatno
2. Umbar Riyanto